Trabajar en forma conjunta por los derechos humanos de la población LGBTIQ ha sido uno de los objetivos de la alianza entre la Fundación Justicia y Género y la Procuraduría para la Defensa de los Derechos Humanos de El Salvador.
Desde hace varios meses un equipo latinoamericano de personas expertas en la administración de justicia ha trabajado en la elaboración de un Protocolo Modelo de Investigación de Crímenes y Delitos generados por Prejuicios contra las personas LGBTIQ. Este protocolo ha sido apoyado por las procuradurías de derechos humanos de El Salvador y Guatemala.
Como parte de este proceso se organizó un curso para funcionarias y funcionarios de esta con el fin de fortalecer sus conocimientos y facilitar la divulgación y capacitación del Protocolo en mención.